生殖道衣原體感染的診斷需要依靠性接觸史、臨床表現(xiàn)和化驗檢查結(jié)果。當(dāng)有典型的尿道炎、宮頸炎癥狀時，診斷不難。但由于無癥狀感染多見，化驗檢查顯得十分重要。

通過化驗可以確定病因，從而針對病因進(jìn)行治療，并有助于對病人的性伴作治療以防止進(jìn)一步傳播。還可發(fā)現(xiàn)無癥狀感染者，有助于消除傳染源。在女病人中檢查并治療衣原體感染將能防止異位妊娠或不育的發(fā)生。

診斷沙眼衣原體感染的化驗檢查方法包括標(biāo)本涂片染色顯微鏡檢查、衣原體培養(yǎng)法、衣原體抗原檢測、dna檢測及pcr檢測。涂片檢查是一種簡便、價廉的診斷方法，可用于新生兒眼結(jié)膜刮片的檢查，但它不適宜用于生殖道沙眼衣原體感染的診斷，因為在這種情況下，它的敏感性和特異性均極低。

衣原體培養(yǎng)是目前檢測沙眼衣原體感染最為敏感和特異的方法，敏感性為70%～95%，可用作確證試驗和治療后的判愈試驗，但實驗室條件要求高，價格昂貴?？乖瓩z測法診斷沙眼衣原體感染的敏感性為70%～90%，特異性為83%～99%，快速，價廉，操作簡便，但對于實驗人員的技術(shù)水平要求較高。pcr診斷生殖道沙眼衣原體感染的敏感性高于培養(yǎng)法，特異性可達(dá)99%～100%，但檢測條件和操作人員的水平要求高，容易導(dǎo)致出現(xiàn)假陽性結(jié)果，僅適合在高級別或機構(gòu)開展。