甲亢的藥物治療通常分為控制期、減量期和維持期三個不同階段，不同的階段，抗甲狀腺藥物的用量和時間都不一樣。“控制階段”所需的藥物劑量較大，目的是在較短的時間內將病人過高的甲狀腺激素水平降至正常，時間大約需要4周~6周。待病人甲功（ft3、ft4、tsh）降至正常水平以后，就進入“減量階段”，此時應逐步減少抗甲狀腺藥物的劑量，以防矯枉過正，出現(xiàn)“藥物性甲減”，一般每兩周減一次，每次減1片～2片，這個過程大約需要2個月～3個月。當抗甲狀腺藥物減至每天1片～2片左右（他巴唑5毫克～10毫克/天或丙基硫氧嘧啶50毫克～100毫克/天）而甲功依舊正常，此時不能停藥，而應繼續(xù)用小劑量長期維持，“維持階段”大約需要1.5年～2年甚至更長。

然而，有些甲亢病人經(jīng)過藥物治療，癥狀完全消失或是“甲功”恢復正常以后就擅自停藥，這樣做非常不妥，極易復發(fā)。一般而言，藥物治療甲亢的療程至少需要1.5年～2年，如果有家族史、治療復發(fā)者，服藥時間還需進一步延長。切不可過早停藥，也不能用用停停，否則極易導致甲亢復發(fā)。一般認為，只有同時滿足下列幾個條件方可停藥①甲亢癥狀完全消失，甲狀腺縮小，血管雜音消失，突眼改善。②甲功（ft3、ft4、tsh）恢復正常，甲狀腺刺激性抗體（tsab）轉陰。③藥物維持劑量小。④總的療程達到兩年以上。