化療是通過口服或者血管注射藥物來治療腫瘤。這些藥物隨著血流到達(dá)人體各個部分發(fā)揮抗癌作用，在某些轉(zhuǎn)移性腫瘤中效果尤為明顯。但是，膽囊癌似乎對化療不敏感，正式由于這個原因，化療并沒有廣泛用來治療這種癌癥。

單獨使用化療并不能夠治愈膽囊癌，如果沒有外科手術(shù)或者放療，化療并不能增加膽囊癌的生存率。因此，化療通常作為一種輔助療法來增強(qiáng)其他療法特別是手術(shù)的療效。

有些研究發(fā)現(xiàn)某些化療藥物如絲裂霉素或者其與5-fu或多柔比星聯(lián)合使用時，絲裂霉素能縮小膽囊癌。但是腫瘤縮小50%或以上的比率很小。因此，大多數(shù)醫(yī)生并不推薦化療與手術(shù)連用。最近，醫(yī)生們報道一些新的成功聯(lián)合用藥方案，吉西他濱和順鉑卡培他濱聯(lián)合應(yīng)用。

醫(yī)生們發(fā)現(xiàn)在與放療聯(lián)合應(yīng)用時化療效果更佳。不管有沒有進(jìn)行手術(shù)，這些聯(lián)合治療均能在短時期內(nèi)控制膽囊癌。目前有更多的研究在計劃這些或類似的聯(lián)合用藥方案。

直接肝動脈輸注（把藥物直接注射肝動脈）能把一些化療藥物帶到肝臟，這種方案對于那些不能通過外科切除的癌癥病人效果較好，能延長病人生命。