引起非典型肺炎的病原體很難通過培養(yǎng)獲得,所以常規(guī)檢查通常無法發(fā)現(xiàn)這些致病微生物。近年來的調(diào)查顯示,非典型病原體所占比重持續(xù)增加。歐洲10國的26項(xiàng)前瞻性研究表明,在5961例cap住院患者中,3種主要非典型病原菌感染的發(fā)病率分別位列第2（肺炎衣原體）、第4（肺炎支原體）和第5位（嗜肺軍團(tuán)菌）。北美臨床研究顯示,在cap門診患者中,非典型病原診斷率為30%~55%,住院患者為8%~44%。我國對cap致病原的初步調(diào)查結(jié)果顯示,非典型致病原的檢出率約為30%~33.6%?？傮w來說,導(dǎo)致cap的非典型病原體可占到近40%,各個(gè)年齡段均可感染,病情從輕、中度至重度不等。肺炎支原體和肺炎衣原體一般在門診患者中常見,而軍團(tuán)菌在重癥住院患者尤其是需入住icu的患者中常見。我國最近的流調(diào)顯示,肺炎支原體和肺炎衣原體常作為cap混合感染的一部分,而肺炎鏈球菌和流感嗜血桿菌屬于混合感染還是繼發(fā)感染尚不確定,但混合感染無疑死亡率更高。2007年美國感染病學(xué)會(huì)/美國胸科學(xué)會(huì)（idsa/ats）指南建議,cap初始經(jīng)驗(yàn)治療應(yīng)考慮覆蓋非典型病原體。治療非典型病原體感染的傳統(tǒng)藥物是紅霉素。但近年來,新大環(huán)內(nèi)酯類（阿奇霉素、克拉霉素、羅紅霉素）和喹諾酮類（環(huán)丙沙星、氧氟沙星、左氧氟沙星、莫西沙星）抗生素的療效要優(yōu)于紅霉素,在非典型肺炎的治療中占主導(dǎo)地位。